雖然現在大多數沭花復合肥都必須是多元的,但仍然不能完全取代有機肥,有條件的地方應盡量增加腐熟有機肥的施用量。復合肥與有機肥配合施用,可提高肥效和養分的利用率。有機肥的施用,不僅改良土壤,活化土壤中的有益微生物,更重要的是節省能源,減輕環境的污染。使用一些生物有機肥,不但可免去傳統制作有機肥的繁瑣過程,而且可為土壤提供大量的有益微生物活化土壤養分,減少連作障礙。